Im August 1999 sind die Kinder Tai, Matt, Sora, Izzy, Joey, Mimi und T.K. gemeinsam im Sommercamp. Plötzlich beginnt es heftig zu schneien, vor den Kindern erscheinen Digivices und sie werden in die Digiwelt transportiert. Dort landen sie auf der File-Insel, wo sie auf die ersten Digimon treffen. Kurz darauf werden sie von Kuwagamon, einem riesigen Käferdigimon, attackiert. Mit Hilfe der Digivices können ihre Partnerdigimon sich weiterentwickeln und den Feind besiegen. Sie begeben sich dann gemeinsam auf eine Reise durch die Digiwelt und fragen sich bald, was diese wirklich ist und wie sie wieder nach Hause kommen. Nun müssen sie zuerst gegen Devimon bestehen, das die Digiwelt mit seinen schwarzen Zahnrädern beherrschen will. Schließlich kann Devimon besiegt werden, doch stirbt dabei Patamon.
Bald erfährt die Gruppe, dass sie die Digiritter sind, die gegen das Böse der Digiwelt kämpfen sollen. Sie erkennen auch, dass Veränderungen in der digitalen Welt Auswirkungen auf die Menschenwelt haben können. Auf dem Kontinent Server angelangt, kämpfen sie zuerst gegen Etemon, der die Digimon mit einem dunklen Netzwerk kontrollieren will. Dann erfahren sie von Myotismon, der die Digiwelt und die Welt der Menschen vereinen, in Dunkelheit stürzen und regieren will. Dazu reist er in die Welt der Menschen und die Digiritter folgen ihm. Dort stößt der achte Digiritter, Kari, zu ihnen und mit ihr Gatomon, der zuvor ein Anhänger Myotismons war. Gemeinsam gelingt es, Myotismon zu töten.
In der folgenden Zeit treten vier mächtige Digimon auf, die sich zum Ziel gesetzt haben, die Digiritter zu vernichten, die Meister der Dunkelheit. Der erste, MetalSeadramon, herrscht über das Meer, der zweite, Puppetmon, über den Wald, der dritte, Machinedramon, über das Metall und der vierte, Piedmon, über die Dunkelheit. Mit vereinten Kräften können alle vier besiegt werden. Doch dann taucht plötzlich Apocalymon auf, ein ausgestoßenes Digimon, das sich rächen will. Es vereint in sich alle Fähigkeiten der vorherigen Gegner, kann aber dennoch am Ende besiegt werden.